Деревянный пол в погребе, конечно лучше не делать, но это не значит что он обязательно сгниет. Лучшим вариантом будет изготовление армированного, заливного, бетонного пола. Хоть бетон сырости и не боится, я бы советовал приобрести специальное покрытие для бетонных поверхностей, которые придадут большую прочность, и обеспечат дополнительную защиту вашему полу.